Karena mutasi virus korona baru (SARS-CoV-2), pemerintah Inggris mengumumkan pada 19 Desember bahwa mereka akan memberlakukan lockdown level 4 di Inggris tenggara, termasuk London, yang berarti bahwa orang-orang di daerah ini harus tinggal di rumah, bahkan jika Anda tidak bisa berpesta dengan keluarga lain pada hari Natal.
Mutasi baru ini terutama merupakan mutasi asam amino utama N501Y di daerah pengikatan reseptor (RBD) dari protein S Coronavirus baru. Penelitian telah menunjukkan bahwa ini mempermudah virus corona baru untuk mengikat reseptor ACE2 manusia, sehingga memberikan potensi untuk mempercepat penyebaran virus corona baru.
Stuart Neil, ahli virologi di King's College London, mengatakan bahwa virus mutan ini hanya dikaitkan dengan 10% hingga 15% kasus beberapa minggu lalu, dan menyumbang 60% kasus London minggu lalu. .
Pada 13 Desember, hampir 60 departemen lokal di Inggris mengonfirmasi bahwa 1.108 kasus terinfeksi virus korona baru yang menghasilkan mutasi ini, dan jumlah infeksi sebenarnya mungkin jauh lebih tinggi.
Jadi, apa arti mutasi baru ini? Apa dampaknya terhadap pencegahan dan pengendalian epidemi saat ini? Apakah itu akan mempengaruhi efek vaksin mahkota baru yang akan datang?
01 Varian dari virus mahkota baru Inggris
Sebagai virus RNA, tidak mengherankan jika muncul varian baru dari virus corona baru.
“Mutasi pada gen virus bersifat abadi. Mutasi yang dapat kami deteksi adalah virus yang berhasil bertahan dan menyebar,” kata Shi Zhengli, peneliti di Institut Virologi Wuhan, Akademi Ilmu Pengetahuan China yang telah mempelajari virus korona selama bertahun-tahun.
Sejak urutan genom virus korona baru pertama diunggah ke database, para ilmuwan telah memantau evolusi virus korona baru secara real time.
Secara umum, varian baru menarik perhatian, baik karena frekuensi peredaran tiba-tiba meningkat, seperti varian Eropa D614G, dan bukti eksperimental berikutnya juga menunjukkan bahwa infektivitas memang meningkat; atau karakteristik klinis telah berubah secara signifikan, seperti ORF8 Singapura awal Variannya hilang, dan eksperimen selanjutnya menunjukkan bahwa patogenisitas varian menjadi lebih lemah.
Perubahan klinis ini terlihat dengan mata telanjang, tetapi apakah karakteristik imunologi yang diinduksi berubah membutuhkan lebih banyak eksperimen untuk membuktikannya. Dilihat dari derajat mutasi sebagian besar strain baru, respon imun yang diinduksi tidak berubah secara signifikan.
Kali ini, varian baru virus corona baru di Inggris ditemukan melalui database pemantauan. Menurut sifat mutasinya, ia terbagi menjadi cabang baru B.1.1.7 pada pohon filogenetik. Dalam empat minggu terakhir, frekuensi silsilah ini meningkat pesat dan terus menyebar di Inggris.
Dua pabrik pertama, satu dari Kent pada 20 September 2020, dan yang lainnya dari London Raya pada 21 September 2020. Pada awal Desember 2020, infeksi garis keturunan B.1.1.7 telah terus terdeteksi di Inggris. Pada tanggal 15 Desember, total 1.623 urutan genom telah diunggah ke garis keturunan B.1.1.7, dimana 519 berada di London Raya dan 555 di Kent. , 545 di bagian lain Inggris (termasuk Skotlandia dan Wales), dan 4 di negara lain.
"Tidak ada data yang menunjukkan bahwa ini dibawa dari luar negeri," kata Nick Loman, profesor genomik mikroba dan bioinformatika di University of Birmingham. "Ini mungkin telah berevolusi di Inggris."
Untuk virus korona baru, mutasi terakumulasi pada tingkat yang pada dasarnya konstan dari waktu ke waktu (sekitar 1-2 mutasi per bulan). Saat ini, sebagian besar galur umumnya memiliki beberapa mutasi dibandingkan dengan galur asli, tetapi B .1.1.7 Ada banyak lokasi mutasi yang terakumulasi dalam silsilah, terutama termasuk 6 mutasi sinonim, 14 mutasi non-sinonim, dan mutasi delesi 3. Kecepatan evolusinya tidak normal dan jarak dari akar relatif panjang.
Sumber silsilah ini belum diketahui. Diperkirakan hal itu mungkin disebabkan oleh infeksi kronis atau obat-obatan pada pasien yang mengalami defisiensi imun, seperti plasma pasien yang sembuh atau redecivir. Ada juga bukti sebelumnya bahwa tekanan seleksi akan mempercepat evolusi virus corona baru. .
Maria Van Kerkhove, kepala aspek teknis respons mahkota baru Organisasi Kesehatan Dunia, mengatakan bahwa mutasi virus ini telah dipantau oleh Kelompok Kerja Evolusi Virus Organisasi Kesehatan Dunia. "Variasi ini terkait dengan varian cerpelai yang ditemukan di tempat lain."
Apa arti dari strain mutan baru?
Secara khusus, perubahan apa yang terjadi pada strain yang baru bermutasi di Inggris?
Di antara mutasi protein S garis keturunan B.1.1.7, situs mutasi yang paling penting adalah mutasi asam amino kunci N501Y dalam RBD (daerah pengikatan reseptor), dan tempat ini sangat penting. Pada 30 Juli tahun ini, ilmuwan Tiongkok Zhou Yusen dan lainnya menerbitkan sebuah penelitian di Science yang menunjukkan bahwa virus corona baru beradaptasi dan menginfeksi tikus tipe liar karena mutasi N501Y ini. Mutasi ini sangat meningkatkan afinitas RBD dan reseptor ACE2, dan memungkinkan strain virus korona baru yang tidak menginfeksi tikus dapat menginfeksi tikus.
Sebuah makalah yang diterbitkan di Cell pada bulan September tahun ini menunjukkan bahwa para ilmuwan di Fred Hutchinson Cancer Research Center dan University of Washington menemukan bahwa sejumlah besar mutasi asam amino di daerah pengikatan reseptor virus corona baru meningkatkan kemampuan untuk mengikat ACE2. Telah diprediksi bahwa mutasi di situs N501F / T meningkatkan afinitas dengan ACE2 manusia, tetapi mereka tidak memiliki bukti bahwa strain yang bersirkulasi menghasilkan mutasi ini.
Situs mutasi penting lainnya adalah mutasi penghapusan H69 dan V70 (69-70del) di domain terminal-N (NTD). Varian ini pertama kali muncul pada bulan Juli dan juga muncul di Inggris, Belanda, dan Australia. Kemunculan yang sering di cerpelai Denmark telah menyebabkan keprihatinan yang luas. Diantaranya, sering muncul dengan Y453F di mink, dan sering muncul dengan N439K pada manusia. Penelitian telah menunjukkan bahwa mutasi 69-70del akan melepaskan diri dari efek netralisasi beberapa antibodi monoklonal, dan juga dapat mengurangi sensitivitas netralisasi beberapa serum.
Mutasi P681H pada protein S mungkin juga memiliki dampak potensial pada karakteristik virus. Situs ini berdekatan dengan situs pembelahan Furin S1 / S2 dari protein S. Situs pembelahan Furin penting untuk infeksi sel inang oleh virus korona baru. Infektivitas virus juga dapat terpengaruh, tetapi belum ada bukti eksperimental yang jelas. Selain itu, situs mutasi lain pada protein S diperkirakan memiliki pengaruh yang kecil pada fungsi dan belum menarik perhatian.
Selain protein S, mutasi Q27stop pada ORF8 menyebabkan protein ORF8 berhenti lebih awal dan kehilangan fungsinya. Pada tahap awal pandemi, sejumlah strain mutan penghapusan ORF8 diisolasi di seluruh dunia, dan banyak penelitian telah menjelaskannya. Strain ini sedikit mempengaruhi replikasi dalam sel saluran napas primer manusia dan dikaitkan dengan infeksi dan infeksi klinis yang lebih ringan. Lebih sedikit peradangan terkait dengan infeksi, yaitu patogenisitas berkurang.
Hingga saat ini, situs mutasi lainnya belum bisa dijelaskan dengan jelas. Penting untuk diperhatikan bahwa varian baru ini mengandung beberapa situs mutasi, sehingga fungsi spesifiknya harus mempertimbangkan hasil komprehensif dari semua situs mutasi.Tidak ada bukti pasti yang membuktikan bahwa varian baru ini efektif dalam virologi dan imunitas. Apa dampak karakteristik akademis.
Beberapa komentator percaya bahwa berdasarkan situasi di Inggris Raya, kemungkinan dapat menular seperti varian D614G, dan apakah itu mempengaruhi patogenisitas dan pelarian kekebalan memerlukan lebih banyak bukti eksperimental tindak lanjut.
Menurut risalah pertemuan British Emerging Respiratory Virus Crisis Advisory Group pada tanggal 18 Desember, tingkat pertumbuhan infeksi dengan strain baru adalah 71% lebih tinggi dibandingkan dengan strain lain.
Menteri Kesehatan Inggris Matt Hancock menekankan bahwa tidak ada indikasi bahwa varian virus baru akan menyebabkan penyakit yang lebih serius atau vaksin tidak akan berfungsi lagi.
Perlu dicatat bahwa sebagian besar vaksin terkemuka saat ini menggunakan protein S sebagai imunogen, yang mengandung banyak epitop untuk menginduksi serum antibodi poliklonal. Meskipun beberapa lokasi mutasi dapat lepas dari antibodi monoklonal, mereka tidak akan menetralkan seluruh serum. Seks berdampak besar. Sebagai contoh, makalah Science yang disebutkan di atas menunjukkan bahwa galur dengan mutasi N501Y masih dapat dinetralkan oleh antibodi penawar RBD khusus virus corona baru.
Jiang Shibo, direktur Institut Mikrobiologi Patogen, Universitas Fudan, mengatakan kepada Intellectuals, “Pengembang vaksin dan antibodi harus menggunakan galur mutan ini untuk mengujinya sesegera mungkin untuk melihat apakah antibodi yang mereka kembangkan atau antibodi yang diinduksi oleh vaksin masih efektif? Jika strain mutan ini tidak dapat dinetralkan secara efektif, ada kebutuhan mendesak untuk mengembangkan vaksin dan antibodi anti-coronavirus generasi kedua yang lebih efisien dan berspektrum luas. "
Jiang Shibo juga menunjukkan bahwa perlu dipelajari apakah patogenisitas strain mutan ditingkatkan secepat mungkin. Jika patogenisitas juga meningkat, rencana pengobatan harus disesuaikan.
03 Negara-negara telah mengadopsi untuk mengisolasi Inggris
Inggris, yang pertama kali menemukan varian baru dari virus mahkota baru, segera berinvestasi dalam tahap baru pencegahan dan pengendalian epidemi.
Sejak 20 Desember, kendali Inggris tenggara, termasuk London, ditingkatkan ke blokade level 4. Dibandingkan dengan pengukuran level 3 sebelumnya, toko non-esensial, toko tukang cukur, pusat kebugaran dan tempat hiburan lainnya di bawah kendali baru semuanya ditutup.Selain pendidikan, perawatan anak, olahraga, belanja atau tidak dapat bekerja dari rumah, orang-orang di area ini harus mencoba untuk tinggal di rumah , Keluarga yang berbeda tidak dapat berkumpul, hanya pertemuan umum tatap muka yang diperbolehkan.
Tindakan pencegahan dan pengendalian ini akan berlanjut hingga 30 Desember, ketika pemerintah Inggris akan membuat penilaian lain. Untuk Inggris Raya, ini berarti tidak akan ada pesta, pasar Natal, dan pesta belanja besar Boxing Day pada Natal di zona tertutup tahun ini. Area di luar blokade akan dideregulasi pada Hari Natal pada 25 Desember di bawah langkah-langkah kontrol asli.
Di luar Inggris Raya, banyak negara telah mengumumkan larangan atau penangguhan masuknya orang-orang dari Inggris Raya.
Pada 20 Desember, Belanda pertama kali mengumumkan larangan perjalanan ke Inggris, yang akan berlangsung setidaknya hingga 1 Januari 2021. Selain itu, Jerman, Irlandia, Belgia, Austria, Swiss, Portugal, Finlandia, Kroasia, Bulgaria, Italia, Swedia, Rumania, Estonia, Latvia, Lituania, Kanada, India, Israel, Iran, Arab Saudi, Turki, Maroko, El Salvador, Kolombia Negara-negara seperti Kuwait dan Kuwait juga telah mengumumkan berbagai tingkat larangan perjalanan di Inggris Raya.
Prancis, yang menghadap Inggris di seberang laut, akan menangguhkan transportasi penumpang dan barang dari Inggris selama 48 jam mulai pukul 23:00 (GMT) pada 20 Desember. Keputusan ini juga akan berdampak pada terowongan bawah laut yang menghubungkan Kent, Inggris dengan Prancis, yang melalui kereta dan truk Eurostar yang mengimpor makanan dan kebutuhan sehari-hari dari Inggris.
Menteri Kesehatan Inggris Matthew Hancock percaya bahwa pembatasan domestik di Inggris dapat berlanjut selama beberapa bulan sampai vaksin tersebut sepenuhnya divaksinasi.
Saat ini, Inggris telah membeli 40 juta vaksin Pfizer, dengan memprioritaskan lansia dan pekerja medis. Pada 21 Desember, Menteri Transportasi Inggris Grant Shapps (Grant Shapps) mengatakan dalam sebuah wawancara dengan Sky News bahwa larangan pengiriman Prancis tidak akan berdampak pada vaksinasi Inggris.
Meskipun mutasi yang dilaporkan ini mungkin tidak memengaruhi keefektifan vaksin yang ada, cara hidup berdampingan dengan virus korona baru dan cara menangani mutasi lain yang mungkin dihasilkan oleh virus korona baru masih merupakan pengujian yang berkelanjutan untuk negara-negara.
"Baik dunia akan bekerja sama untuk mengepung, mengejar dan mencegat, menambahkan vaksin, dan menghilangkannya seperti virus cacar dan virus polio, tetapi dengan mengorbankan ekonomi. Atau menggunakan metode isolasi ringan dan hidup berdampingan dengannya seperti virus flu." Dan masa depan virus korona baru, Shi Zhengli dianalisis ke "Intelektual" sebagaimana dikutif warta kaltim dari new.qq.com 21/12/2020
“Dilemanya adalah tidak ada konsensus tentang bagaimana menangani epidemi secara global,” tambahnya.
